Reforçando alguns já ditos, e/ou metendo propostas novas:
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PILHAS NÃO!!!!!

quanto muito baterias recarregáveis, MAS COM A EXIGÊNCIA de serem facilmente "trocáveis"...
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Retrocompatibilidade? Sem dúvida... Se já aguentaram de 4,5v para 12v para 9v e para IR... há algum problema em manter a "Bitola"?
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Electrificação das linhas SIM! mas não de "voltagem variável" ... (não venham com desculpa dos carris ficarem mais caros... A diferença de preço entre as linhas "metálicas" e "plásticas" não é assim tanta... (a não ser que a margem de lucro deles tenha aumentado...)
(ou em alternativa)
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ELECTRIFICAÇÃO AÉREA ... e os motores poderem receber energia através de dois sistemas: bateria ou pantógrafo...
(no seguimento da anterior, o novo controle para os comboios, já que era pela variação de voltagem que eram controlados)
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Controle Remoto para os motores (NÃO ao estilo Infravermelho, mas com MUITO mais canais... E BlueTooth porque não???)
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Funcionalidades "novas" (algumas já existentes nas linhas 12v) tais como sinais, sensores de linha (para comandar cancelas, mudanças de linha automática, etc)... Não só permitiria ter um comboio mais interactivo de um cenário, como permitiria "automatizar" quase na totalidade um layout com vários comboios na linha, sem que nenhum dos comboios alguma vez chocar um com o outro!

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Entroncamentos de Linha permitirem uma curva de 90º ao invés de fazerem aquela curva forçada para o lado "paralelo"
(Tal como no monocarril, havia a possibilidade de ou fazer 90º ou ir para uma linha paralela... bastava meter numa peça "monorail point" com uma com a curva para o lado inverso ao "point" (ex: para a peça
2890, a
2891 )
Não sei se é pedir muito ou pouco... são ideias. E não são ditas "no ar"...